Das aufdecken von Fehlern in der biomedizinischen Forschung-Ergebnisse: Neue fact-checker sorgt für Wissenschaftler Kochen mit den richtigen Zutaten

Krebsforscher Professor Jennifer Byrne von der Universität von Sydney in der Hoffnung, dies zu ändern, mit der Schaffung eines weltweit ersten “ fact-checking-Programm, das ist, sich mit dem problem des falsch veröffentlichten biomedizinischen Forschung Ergebnisse, absichtlich oder nicht.

In einem Papier, veröffentlicht in PLOS ONE, Professor Byrne und Kollegen Dr. Cyril Labbé von der Universität Grenoble Alpes (Frankreich) detail ‚Suchen & Blastn‘, die Tatsache-überprüfung-computer-Programm, das Sie entwickelt haben und Sie frei zugänglich gemacht, um Forscher.

Das Programm überprüft die Identitäten der veröffentlichten Nukleotid-Sequenz Reagenzien (DNA-und RNA-Konstrukte verwendet, um Ziel-Gene) durch die Suche nach Sequenzen innerhalb Papiere und läuft Ihnen über eine Datenbank, in der die fülle von wissen über Gene zu Datum.

„Die biomedizinische Reagenzien sind wie Zutaten in der Küche. Sie nutzen Sie, um zu entdecken, dass Ihre experimentellen Ergebnisse. Macht ein experiment mit falschen Reagenzien entweder bedeutet, dass Sie Kochen etwas anders aus, was Sie dachte, Sie waren zu Kochen, oder was Sie Kochen, ist ein Misserfolg“, sagte Byrne, Professor der Medizinischen Onkologie in der Sydney Medical School.

„Leider mit Experimenten, Fehler sind nicht immer so offensichtlich, wie Sie in der Küche. Und hier haben wir es mit grundlegenden genetischen Forschung, und andere Forscher über diese Fehler als Bausteine für die eigene Arbeit.“

In einer Kohorte von 155 Forschungsarbeiten, die neue fact-checker in Kombination mit manueller Analyse identifizierte 25 Prozent der Papiere als Folge von Fehlern. Die Forscher testeten auf eine vermutete Gruppe der Papiere, die so, während die Abbildung spiegelt nicht in einer baseline-Fehlerrate, die zahlen sind immer noch erschreckend.

„Das ist eine ganze Menge von falschen Sequenzen in einer kleinen Gruppe von Papieren und es gibt viele mehr gibt, leider, gegeben, dass die Nukleotid-Sequenz Reagenzien beschrieben worden sind buchstäblich Hunderte von tausenden von biomedizinischen Veröffentlichungen“, sagte Professor Byrne.

Die Forscher fanden heraus, dass Fehler vertreten sowohl Identität Fehler (Sequenzen, die waren völlig falsch) und typografische Fehler (Sequenzen, die das äquivalent von Rechtschreibfehlern). Die Autoren schlagen vor, dass die Sequenz-Identitäts-Fehler könnte einen bestimmten Markenzeichen der Forschung-Betrug und könnte angewendet werden, um zu identifizieren betrügerische Papiere und Manuskripte.

„Unsere Hoffnung ist, dass tools wie Suchen & Blastn wird voraussichtlich abschrecken Publikationen beschreiben, dass falsche Nukleotid-Sequenz Reagenzien und können Flagge vorhandenen Publikationen so, dass Ihre Schlussfolgerungen können neu bewertet werden“, sagte Professor Byrne.

Fehler aufgedeckt enthalten:

  • Sequenz Reagenzien, die eigentlich als Ziel ein bestimmtes gen, sind aber in der Tat vorhergesagt, auf eine unterschiedliche gene angegeben, die in der Publikation, was in den Daten erfasst, die nichts zu tun mit dem system untersucht.
  • Sequenz Reagenzien, die sollen nicht beliebige gen (als negative Kontrolle), sondern eine prognostizierte Ziel eines menschlichen Gens, was bedeutet, die Forscher sind nicht Vergleich der experimentellen Daten, um eine ordnungsgemäße negativ-Kontrolle.
  • Sequenz-Reagenzien, soll Ziel eines menschlichen Gens, das in der Tat nicht scheinen, um beliebige gene, die dazu führen Experimente nicht funktioniert, aber die Forscher werden nicht bewusst ist.

Professor Byrne, genannt in der Natur – Zeitschrift “ Top 10 Forscher für 2017, ist bekannt für Ihre detektiv-Arbeit, die Aufdeckung betrügerischer Ergebnisse in wissenschaftlichen Journalen veröffentlicht.

Ihre bisherige Arbeit hat dazu geführt, in siebzehn Einziehungen, aber Sie sagt, der Prozess ist langsam und beschwerlich, mit dem Mangel an Antworten aus Zeitschriften entmutigend.

In einem editorial In Nature im letzten Monat schrieb Sie: „Solche Papiere behaupten, die Mechanismen aufzudecken, die hinter einer Schneise von Krebs und seltene Krankheiten. Sie könnte entgleisen Bemühungen um die Identifizierung leicht messbare Biomarker für die Verwendung in der Vorhersage von Krankheitsverlauf oder ob ein Medikament funktioniert.

„Wir schaffen die Literatur, die wir verdienen. Wir müssen handeln gegen dieses unter-anerkannte Bedrohung für die gültige Wissenschaft.“