Präzise Erkennung von low-level-somatischen mutation in pharmakoresistenter Epilepsie

KAIST medizinische Forscher haben entwickelt, um eine erweiterte Methode für perfekt erkennen von low-level-somatischen mutation bei Patienten mit pharmakoresistenter Epilepsie. Ihre Studie zeigte, dass deep sequencing Wiederholungen von schweren fokalen Epilepsie-Gene genau und effizient identifiziert low-level-somatischen Mutationen bei hartnäckigen Epilepsie.

Laut der Studie, Ihre diagnostischen Methode ist die Steigerung der Genauigkeit bis zu 100%, im Gegensatz zu den herkömmlichen Sequenzierung Analyse, die liegt bei etwa 30% Genauigkeit. Diese Arbeit wurde veröffentlicht in Acta Neuropathologica.

Epilepsie ist eine neurologische Störung, die Häufig bei Kindern. Etwa ein Drittel der Kind Patienten mit pharmakoresistenter Epilepsie trotz ausreichender anti-epileptischen Medikamenten behandelt.

Somatische Mutationen im mTOR-Signalweg-Gene, SLC35A2, und BRAF sind die wichtigsten genetischen Ursachen von hartnäckigen Epilepsien. Eine klinische Studie Ziel der Fokalen Kortikalen Dysplasie Typ II (FCDII), die mTOR-inhibitors ist im Gange an Severance Hospital, deren Mitarbeiter in Seoul, Korea. Es ist jedoch schwierig, zu erkennen, wie somatische Mutationen verursacht pharmakoresistenter Epilepsie, weil Ihre mutational Belastung ist weniger als 5%, was vergleichbar ist zu der Ebene des sequenzier-Artefakten. Im klinischen Bereich, dies blieb eine ständige Herausforderung für die genetische Diagnostik von somatischen Mutationen in pharmakoresistenter Epilepsie.

Professor Jeong Ho Lee ‚ s team an der Graduate School of Medical Science und Engineering analysiert gepaart Gehirn und peripheren Geweben von 232 pharmakoresistenter Epilepsie Patienten mit verschiedenen Gehirn-Erkrankungen bei Severance Krankenhaus mit Hilfe von deep sequencing und extrahiert die wichtigsten fokalen Epilepsie-Gene.

Sie verengt zielgene zu acht großen fokalen Epilepsie-Gene, wodurch fast alle die falsch-positiv-Anrufe mit tief gezielte Sequenzierung. Als Ergebnis der erweiterten Methode robust erhöht die Genauigkeit und aktiviert Sie zu erkennen, die low-level-somatischen Mutationen in unvergleichlicher Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) Gehirn-Proben, die die meisten klinisch relevanten Proben.

Professor Lee diese Studie durchgeführt in Zusammenarbeit mit Professor Dong Suk und Kim Hoon-Chul Kang an Severance Hospital der Yonsei Universität. Er sagte, „Diese fortschrittliche Methode der genetischen Analyse wird insgesamt verbessern die Versorgung der Patienten durch die Bereitstellung umfassender genetischer Beratung und Information für Entscheidungen über alternative Behandlungen.“